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1)速率區帶法(rate zonal)： 

　　根據樣品中不同粒子所具有的不同的尺寸大小及沉降速度(S)。大致步驟如下： 

　　在離心管中裝入密度梯度溶液，溶液的密度從離心管頂部至底部逐漸增加(正梯度)。 

　　將所需分離的樣品小心地加至密度梯度溶液的頂部。樣品在梯度溶液表面形成一負梯度。 

　　由于不同大小的粒子在離心力作用下，在梯度中移動的速度不一樣，所以經過離心后會形成幾條分開的樣品區帶。 

　　注意：樣品粒子的密度必須大于梯度液注中任一點的密度。離心過程必須在區帶到達管子底部前停止。 

2)等密度離心法(isopycnic)： 

　　根據粒子的不同密度來分離。離心過程中，粒子會移至與它本身密度相同的地方形成區帶。 

　　密度樣度的選擇要使梯度的范圍包括所有待分離粒子的密度。樣品可以在密度梯度液粒上面或均勻分布在密度梯度中。經離心后，樣品粒子達到它們的平衡點。注意：平衡后粒子的分離*由其密度決定，與時間無關，此時再改變離心轉速，只能改變區帶的相對位置。