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基因組測序被簡化
2013-2-20 閱讀(1054)
基因組測序被簡化
近日,英國研究人員將基因組測序的標準流程簡化,無需進行文庫制備且只要很少量的DNA就能獲得序列數據,完成DNA(脫氧核糖核酸)單分子測序,用量可低至不到1納克(10億分之一克),僅為常規測序方法的500分之一到600分之一。
論文作者、英國威康信托基金會桑格研究所的保羅·庫普蘭說:“我們用這種方法對病毒和細菌的基因組測序后發現,即使在相對較低的水平,我們也能夠確定所檢測的是何種有機物,不論樣本中是否存在特定的基因或質粒,或者其他信息,如對特定DNA堿基的修改等。”
威康信托基金會桑格研究所的哈羅德·斯維爾德洛說:“我們的技術可以在對所測序列沒有任何先驗知識、沒有特定微生物試劑的條件下,在很短的時間內操作,這是一種很有前途的替代手段,可應用于控制感染等臨床需要。”
通過利用第三代單分子測序系統PacBio RS演示了這種簡化的直接測序方法,事實證明,僅僅用800皮克(千分之一納克)DNA來分析一個生物體的基因組,盡管測序儀只讀取了基因組的70個序列片段,相對于常規測序方法獲得的數據來說不過是很小的一部分,但這些信息足以讓研究人員確定生物體的品種。
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