nanoporetech 使用納米孔測序技術的微生物學
完整的細菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因組,可進行長時間的納米孔測序。通過快速的病原體檢測方法(無論是在實驗室還是在野外),從環境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要,還應附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉錄本進行測序,以進行準確的基因表達和轉錄本亞型分析。
全面分析微生物基因組(DNA或RNA)。準確定位重復區域和結構變異,并使用長測序讀數將質粒與基因組區分開。簡化從頭組裝并更正現有的參考基因組。可擴展以適應您從工作臺到現場的需求。
實時準確識別微生物和相關的抗藥性(AMR)。Oxford Nanopore提供了完整的解決方案-從快速的10分鐘文庫制備(DNA)到使用EPI2ME平臺的實時系統發育和AMR分析。使用宏基因組或靶向16S rRNA方法。使用便攜式MinION或臺式GridION或PromethION設備在樣品源處或實驗室中進行測序。
使用全長納米孔測序讀數,解析轉錄本亞型并測量真實的基因表達譜。低投入量與快速,簡化的工作流程相結合,可進行高度敏感的基因表達分析
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微生物表現出許多類型的堿基修飾,可影響一系列功能,包括基因表達和抗菌素耐藥性。與基于替代測序的分析方法不同,納米孔測序不需要擴增或鏈合成,可以減少偏差并保留修飾的堿基信息,這些信息可以與核苷酸序列一起直接檢測到-無需額外的樣品轉換。
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