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Cell公布新興RNA編輯:CRISPR-Cas13d的細節

閱讀:1823      發布時間:2018-9-27
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導讀

Salk研究所的科學家們報道了CRISPR-Cas13d的詳細分子結構,這是一種可用于新興RNA編輯技術的酶。研究人員通過低溫電子顯微鏡(cryo-EM)對酶進行了剖析,這將有助于大家了解CRISPR系統在RNA編輯方面的細節機制。

 

在過去幾年中,CRISPR-Cas9已經邁過了實驗室的限制,進入了臨床研究的階段。這種基因編輯工具CRISPR-Cas9可以糾正個體細胞內的缺陷,未來可以治愈或預防多種人類疾病。但Cas9系統改變的是DNA,而不是RNA,一些專家認為CRISPR平臺實際上也可以用于修改RNA。

 

現在,Salk研究所的科學家們報道了CRISPR-Cas13d的詳細分子結構,這是一種可用于新興RNA編輯技術的酶。研究人員通過低溫電子顯微鏡(cryo-EM)對酶進行了剖析,這將有助于大家了解CRISPR系統在RNA編輯方面的細節機制。

 

這一研究成果公布在9月20日的Cell雜志上。

 

文章作者,Salk研究所的Dmitry Lyumkis說,“這項研究提供了RNA靶向基因工程的分子藍圖。為進行這種重要生物醫學研究解析了其所需的工具。”

CRISPR初是在細菌中發現,可以將一段遺傳密碼換成另一段遺傳密碼,被稱為“分子剪刀”。在CRISPR-Cas9系統中,Cas9是切割DNA的酶。然而,針對RNA的編輯工具也可以幫助科學家們修改基因的活性,同時不會對基因本身造成yong久性改變——這種改變可能是危險的。

 

“DNA是不變的,但是從DNA中復制的RNA信息總是在變化,”文章另外一位作者,Silvana Konermann說,“通過直接控制RNA來調節這些信息,對于影響細胞的命運具有重要意義。”

 

今年早些時候,Konermann和Helmsley-Salk研究員Patrick Hsu在Cell上發表了另一篇論文(Cas13d:一種小巧而強大的CRISPR核酸酶),發現了名為CRISPR-Cas13d的酶家族,并發現了這種替代CRISPR系統在識別和切割RNA方面是有效的。這一研究還表明,這一工具可用于糾正癡呆癥患者細胞中引起疾病的蛋白質失衡。

 

新研究由Lyumkis和Hsu實驗室合作完成,在之前研究的基礎上,進一步解釋了其工作原理的分子細節。

 

“在我們之前的論文中,我們發現了一個新的CRISPR家族,可用于直接在人體細胞內部設計RNA,”Hsu說, “現在我們已經能夠解析了Cas13d的結構,我們可以更詳細地看到酶如何被引導到RNA,以及它如何能夠切割RNA。這些新知識使我們能夠改進系統,并使其更為有效,為治療基于RNA的疾病的新策略鋪平了道路。”

 

在文章中,研究人員使用cryo-EM在不同的動態狀態下冷凍酶,揭示了Cas13d新的細節,解碼一系列活動,而不是僅僅在一個時間點看到一次活動。

 

“這使我們能夠看到Cas13d是如何引導,結合和靶向RNA的,”文章的作者,Lyumkis實驗室的研究助理Cheng Zhang說。 “我們希望這些新知識能夠幫助擴展基因編輯工具的功能。”

原文標題:

Structural Basis for the RNA-Guided Ribonuclease Activity of CRISPR-Cas13d

(轉化醫學網)

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