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費氏弧菌發光桿菌一般粉狀飼料添加微生物制劑效果較好，顆粒飼料和膨化飼料在加工過程中的高溫可造成10%~30%的芽孢桿菌，90%以上的腸球菌以及99%以上的酵母失活，而乳酸桿菌幾乎全部被殺滅。因此，在顆粒飼料中要使用耐熱，耐擠壓的芽孢桿菌制劑。乳酸菌不耐高溫，應采用凍干后包被或采用噴霧干燥的方式制成的乳酸菌制劑。使用時采用飲水方式，以利于乳酸菌優先粘附于腸壁。

微生物制劑中必須含有相當數量的活菌才能達到效果。當進入動物腸道食糜中外源菌數大于1000萬個每克時，都會對腸道內原有菌群產生較大的影響。因此，微生物制劑在產品中活菌數含量為10億~20億每克時效果*。 我國正式批準的微生物制劑中規定每克芽孢桿菌含量要多于5億個。以酵母菌產品為例，費氏弧菌發光桿菌目前市場上銷售的產品活菌數從每克幾億到200億不等，在選擇是要認真鑒別。
嗜熱脂肪芽孢桿菌    
乳酸片球菌    PediococcusacidilacticiLindner
腸膜明串珠菌    Leuconostoc mesenteroides
棒桿菌屬    Corynebacterium sp.
嗜酸乳桿菌    Lactobacillus acidophilus
嗜酸乳桿菌    Lactobacillus acidophilus
枯草芽胞桿菌    Bacillus subtilis
谷氨酸棒狀桿菌    Corynebacteriumglutamicum(Kinoshitaetal.)Abe ..
乙型溶血性鏈球菌    Streptococcus hemolytic-β
灰黃青霉    PenicilliumgrisofulvumDierckx
里氏木霉    Trichoderma reesei
枯草芽孢桿菌枯草亞種    Bacillussubtilissubsp.subtilis
大腸埃希氏菌    Escherichia coli
產氣莢膜梭菌    Clostridium perfringens
單增李斯特氏菌    Listeria monocytogenes
副溶血弧菌    Vibrio parahaemolyticus
阪崎腸桿菌    Enterobacter sakazakii
福氏志賀氏菌    Shigella flexneri
蠟樣芽孢桿菌    Bacillus cereus
乙型副傷寒沙門氏菌    Salmonella paratyphi β

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