放線菌(Actinomycetes)是一種原核生物類群,在自然界中分布很廣,是一類極其重要的微生物資源,與人類的生產和生活關系極為密切,突出的特性就是能產生大量的、種類繁多的抗生素。放線菌能形成分枝菌絲和分生孢子,呈菌絲狀生長,主要通過形成無性孢子的方式進行繁殖,也可借菌體分裂片段繁殖。放線菌長到一定階段,一部分氣生菌絲形成孢子絲,孢子絲成熟便分化形成許多孢子,稱為分生孢子。
圖1 放線菌模式圖
圖2 放線菌的氣生菌絲和孢子絲
由于孢子因其體積小、質輕、易飄散等特點,極易造成同一固體平板上的不同單克隆菌落間產生交叉污染問題,給放線菌的培養和分離帶來了巨大挑戰。
天木生物的高通量微升級液滴培養組學系統——MISS cell,可將細胞(孢子)包裹于液滴中,形成獨立的培養單元,避免菌絲或孢子飛散至其它液滴單克隆內,從而克服菌株間的交叉污染問題,提高獲得放線菌單克隆的效率和純度。本實驗基于菌絲體實現放線菌的分離與培養,為不產孢子的絲狀菌的分離培養提供一種分離培養方法。
二、使用MISS cell分離培養放線菌
1.樣品預處理,確定上機濃度
收集放線菌菌絲體(30℃,培養4天),加入玻璃株打碎菌絲過濾,通過血球計數板計數,用BM培養基將樣品濃度稀釋至500-1000 CFU/mL,工作流程如下:
圖3 樣本處理工作流程
2.MISS cell分離培養
本實驗共生成2500個液滴,培養96h后進行檢測及分選,經過60分鐘的分選,共得到含菌液滴約500個,MISS cell儀器工作流程如下圖所示。
圖4 MISS cell工作流程
3.實驗結果
1)生長速率對比:不同時間點觀察液滴及平板放線菌生長情況,液滴培養1天后液滴中出現生長,平板培養6天后出現菌絲生長,液滴培養放線菌生長速率顯著優于平板培養,放線菌的最佳培養分選時間為4天。
圖5 放線菌在固體平板上的生長情況
圖6 放線菌在液滴中的生長情況
圖7 放線菌培養4天,在OD模式下的分選情況
圖8 放線菌培養4天,在熒光模式下的分選情況
三、天木生物MISS cell儀器為放線菌的分離、培養和篩選過程提供高通量、高效自動化解決方案
本研究中使用天木生物的MISS cell儀器,共生成2500個液滴,分選得到單菌落約500個,實現放線菌自動化培養和分選,有效避免了菌株之間的交叉污染。同時,對于不產孢子的絲狀菌也提供了一種分離培養方法。本次實驗共計消耗培養基8ml,全程自動化實現液滴生成、培養和篩選至96孔板中,大幅提升單克隆獲取效率,同時有效避免交叉污染問題,為放線菌的單克隆篩選提供了高效工具平臺。
天木生物MISS cell儀器為包括放線菌在內含孢子的細菌,提供了單克隆培養和高通量篩選的高效自動化實驗平臺,為菌株的培養和篩選提供強力支持!