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單細胞測序“加速器“:瑞孚迪,讓功能基因組學研究更快一步!

2024-10-16  閱讀(195)

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單細胞測序技術(shù)被廣泛的應用于功能基因組學研究中,為了探究基因組的動態(tài)表達、調(diào)控機制以及這些機制如何影響生物體的表型,通過單細胞測序更深入地了解細胞間的異質(zhì)性,揭示在生物體發(fā)育、疾病進展過程中單個細胞所扮演的關(guān)鍵角色,對于理解人類疾病的發(fā)生機制、開發(fā)新的治療方法以及推動精準醫(yī)療的發(fā)展具有重要意義。


然而單細胞測序技術(shù)作為工具去使用并不容易,要經(jīng)過單細胞懸液制備,細胞活力質(zhì)控,單細胞標簽,mRNA逆轉(zhuǎn)錄,cDNA擴增、文庫制備等一系列操作后才能進入測序環(huán)節(jié),這些過程且相當復雜,對操作人員的專業(yè)水平要求高,如何建立自動化標準化流程、穩(wěn)定輸出高質(zhì)量文庫仍然是個難題。





瑞孚迪(Revvity)專注于自動化技術(shù)30余年,在測序樣本前處理全流程自動化的解決方案上已大有所成?,F(xiàn)在我們進一步結(jié)合公司在細胞成像、核酸檢測、文庫構(gòu)建等優(yōu)勢產(chǎn)品,為功能基因組研究中的單細胞測序領(lǐng)域貢獻力量。


單細胞懸液制備


Omni Bead Ruptor珠磨均質(zhì)儀可以解決單細胞測序制備程的第一步---單細胞懸液制備。它是一個多功能的臺式設備,其載架運動模式設計有助于樣本解離。加上優(yōu)化的解離管,樣本可被均勻地分解成高活力的單細胞懸浮液。


組織樣本可簡單的放入組織解離管中進行分解,該解離管經(jīng)優(yōu)化設計。

設備可同時容納多達12個解離管,組織分解方法經(jīng)過充分的技術(shù)驗證。




通過使用我們的樣品分解技術(shù)優(yōu)化您的單細胞分離方案,以取代傳統(tǒng)的手動制備方法,不僅提高了通量和速度,更關(guān)鍵的,提高您獲得優(yōu)質(zhì)結(jié)果的信心!


細胞質(zhì)控


精確的細胞計數(shù)和活率評估對于單細胞測序至關(guān)重要。瑞孚迪細胞計數(shù)儀以其先進的硬件設計、智能化的軟件識別,結(jié)合定制試劑與耗材,為細胞定量提供快速有效的方法,可從復雜混亂的樣本中精準識別和定量目標細胞群,用于單細胞測序文庫制備前對細胞的質(zhì)量控制。





Cellaca MX和Cellometer Ascend細胞計數(shù)儀特點:

精確定量細胞

排除無核雜質(zhì)

低樣品量消耗

靈活通量選擇

瑞孚迪細胞計數(shù)平臺配套有全面的試劑、耗材和標準微珠。


文庫制備


瑞孚迪擁有一套測序前樣本制備與質(zhì)控的全流程解決方案。在文庫制備環(huán)節(jié),我們最新開發(fā)了一款專屬機型---Fontus NGS,專門應用于NGS文庫制備。在單細胞測序的文庫構(gòu)建工作中,自動化建庫儀發(fā)揮舉足輕重的作用,無論是形成微滴法 (Droplet) 還是微孔法 (Microwell) ,單細胞被標簽后,都是要進行逆轉(zhuǎn)錄、cDNA擴增與純化、文庫構(gòu)建等制備操作,這些既關(guān)鍵又費時費力的工作都可以在單細胞文庫構(gòu)建儀上輕松完成。





Fontus單細胞文庫構(gòu)建儀為不同通量要求提供兩個機型,24通量和96通量,均可實現(xiàn)全流程自動化,包括溫控、PCR擴增純化等。

不同的單細胞測序平臺的樣本制備流程也不同,F(xiàn)ontus預置了幾大主流單細胞測序平臺的自動化程序方案(經(jīng)廠家驗證),實現(xiàn)了開箱即用,同時強大的廠家技術(shù)服務可支持新自動化方法開發(fā)。


DNA和RNA質(zhì)控


LabChip GX Touch 核酸分析儀使用基于芯片的微流控技術(shù),DNA和RNA的定量和片段大小可以在幾秒鐘內(nèi)完成。小于150 nL的樣品用于片段尺寸和濃度分析,生成高分辨率的、可重復的數(shù)據(jù)。


LabChip微流控技術(shù)使凝膠電泳現(xiàn)代化。

全自動樣本檢測分析最快可達30秒。

提供RNA和DNA樣本完整性量化指標,質(zhì)量評分。



數(shù)字化數(shù)據(jù)格式,便于分析、審查、共享和存檔。

不同通量選擇:處理通量1-24個樣品的型號使用靈活,節(jié)約時間;處理通量1-384個樣品的型號適用于高通量工作流程。


我們以Fontus單細胞建庫儀為例詳細說明其特點








我們以市面上常見的微滴法 (Droplet) 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序工作流程舉例展示瑞孚迪的組合產(chǎn)品





文庫結(jié)果表現(xiàn)


表1:使用瑞孚迪建庫儀對24個單細胞油包水后樣本進行建庫的濃度結(jié)果






使用瑞孚迪建庫儀構(gòu)建的文庫用LabChip質(zhì)控儀檢測片段大小


瑞孚迪產(chǎn)品組合加速單細胞測序流程,助力功能基因組學研究。每個工作環(huán)節(jié)皆有多款設備可供選擇,其中自動化建庫儀有幾個款式可選,均可實現(xiàn)單細胞測序從RNA反轉(zhuǎn)錄開始到文庫建好的自動化流程。不同配置的選擇、不同通量的選擇,讓用戶可以自由的選擇適合自身需求的設備,標準化的操作精準度、均一穩(wěn)定的結(jié)果輸出,讓您在解放雙手的同時建立實驗保障的信心。


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