3.色譜柱使用完成之后須使用相宜溶劑進行清潔處理
色譜柱使用完成之后須使用相宜溶劑進行清潔處理，例如ODS柱宜用甲醇沖洗至基線平衡；當采用鹽緩沖溶液作流動相時，使用完后應用無鹽流動相沖洗；含鹵族 元素（氟、氯、溴）的化合物可能會腐蝕不銹鋼管道，不宜長期與之接觸；裝在液相色譜儀上的色譜柱如不經常使用，應每隔4-5天開機沖洗15分鐘。使用強溶劑沖洗色譜柱對內填料的害是大的，尤是純水，除的色譜柱是耐水的。沖洗色譜柱好的方法是用流動相比例的水系和有機系來沖洗。如果你認為流動相比例無法把色譜柱沖洗干凈或者此比例中有機系占有比例過大，你可以使用內含10%左右的純水來沖洗。
4.保存在乙腈或甲醇中的新色譜柱可以直接使用
理論上液相色譜柱不同于氣相色譜柱需要活化，但是由于液相色譜柱內保存的有機系具有揮發性，因此在使用前還是應該用小流速的和色譜柱內相同的溶劑沖洗一些時間。可以是0.5ml/min，120min，但建議咨詢廠家，根據色譜柱參數設定。
5.色譜柱應該保存在純乙腈或甲醇中
保存色譜柱時應將柱內充滿乙腈或甲醇，柱接頭要擰緊，防溶劑揮發干燥。禁止將緩沖溶液留在柱內靜置過夜或長時間。
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