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確認(rèn)RNA的質(zhì)量常用的三種方法
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是通過(guò)測(cè)定RNA的轉(zhuǎn)錄水平來(lái)評(píng)估基因的活力。RNA樣本提取的質(zhì)量直接影響基因表達(dá)分析。影響RNA品質(zhì)的因素有以下三種：RNA濃度、RNA純度和RNA完整性。
檢測(cè)RNA濃度、純度和完整性的方式主要有以下幾種：
紫外分光光度計(jì)法：
測(cè)量260nm吸收值計(jì)算RNA濃度，測(cè)量260nm/280nm吸收值的比值，用于評(píng)估RNA純度。需要注意的是：在檢測(cè)核酸物質(zhì)時(shí)應(yīng)該在固定的PH溶液中進(jìn)行。
260nm/280nm的比值范圍在 1.9~2.1 之間。＜1.9，說(shuō)明有蛋白質(zhì)殘留；＞2.1，說(shuō)明RNA可能發(fā)生降解。
瓊脂糖凝膠電泳：
完整的RNA通常有三條帶，最亮的是28S條帶，其次是18S條帶，最淡的是5S條帶（部分試劑盒提取時(shí)會(huì)過(guò)濾掉5S條帶）。通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳可以檢測(cè)28S和18S的比值。該方法主要用于檢測(cè)RNA的純度和完整性。
如果28S和18S條帶明亮、清晰、條帶銳利，28S的亮度在18S條帶的兩倍以上，我們認(rèn)為RNA的質(zhì)量。
若RNA條帶出現(xiàn)彌散，原因可能：RNA被核酸酶降解、電壓或電流過(guò)大、上樣量過(guò)高或過(guò)低等。
上述兩種方法在實(shí)驗(yàn)室比較常用，此外還有幾種檢測(cè)方式供大家選擇。
熒光染料檢測(cè)：
通過(guò)熒光染料和RNA結(jié)合，熒光活性增強(qiáng)。此方法的靈敏度較高，主要用于檢測(cè)RNA的濃度。
微毛細(xì)管電泳：
可使用軟件的RIN（RNA Integrity Number）分?jǐn)?shù)評(píng)估，10為RNA完整性最好，0為最差。此方法的靈敏度和分辨率較高，可用于檢測(cè)RNA濃度、純度和完整性。
3’-5’完整性檢測(cè)：
是在一個(gè)RNA樣本中檢測(cè)GAPDH mRNA的完整性來(lái)代表所有RNA的完整性，主要用于檢測(cè)RNA的完整性。