多肽測序是指確定多肽或dànbáizhì分子中氨基酸殘基的順序的過程。這一過程對于dànbáizhì結構和功能的研究至關重要,因為氨基酸序列直接決定了dànbáizhì的三維結構和生物學功能。多肽測序主要依賴于質譜(Mass Spectrometry, MS)技術,尤其是串聯質譜(Tandem Mass Spectrometry, MS/MS)技術。
圖1. 通過質譜法進行肽從頭測序的過程
質譜測序原理
多肽的離子化
在質譜分析中,首先需要將多肽樣品離子化。離子化是將多肽分子轉換為帶電粒子的過程,這一步驟對于后續的質譜檢測至關重要。常用的離子化方法包括電噴霧離子化(Electrospray Ionization, ESI)和基質輔助激光解吸/電離(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization, MALDI)。
離子的分離
離子化后的多肽離子會被送入質譜儀中,通過質量分析器進行分離。質量分析器根據離子的質荷比(m/z)對它們進行分離。常見的質量分析器有時間飛行(Time-of-Flight, TOF)、離子阱(Ion Trap)和傅里葉變換離子回旋共振(Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance, FT-ICR)等。
多肽的碎片化
在MS/MS分析中,選定的前體離子(即特定m/z比的多肽離子)會被進一步碎片化。碎片化是指在控制條件下使多肽離子斷裂,產生一系列代表多肽序列信息的小片段離子。常用的碎片化技術包括碰撞誘導解離(Collision-Induced Dissociation, CID)、電子轉移解離(Electron Transfer Dissociation, ETD)和光子誘導解離(Photon-Induced Dissociation, PID)等。
碎片離子的檢測
碎片化產生的離子片段隨后會被送入第二個質量分析器中進行檢測和分析。通過分析這些碎片離子的m/z值,可以獲得有關多肽氨基酸序列的信息。
序列分析和鑒定
zuì后,利用生物信息學軟件和數據庫匹配技術,根據碎片離子的質荷比和模式,推斷出原始多肽的氨基酸序列。這一步通常涉及到與已知dànbáizhì數據庫的比對,以鑒定未知多肽或dànbáizhì的序列。
多肽測序的準確性和成功率受多種因素影響,包括樣品的純度、離子化效率、碎片化方法以及質譜儀的分辨率和準確性。隨著質譜技術的不斷發展和優化,多肽測序已成為dànbáizhì組學和生物分子研究中bùkěhuòquē的工具
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