泛素化是一種dànbáizhì翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM),它涉及將一個或多個泛素(Ubiquitin)dànbáizhì添加到底物蛋白上。泛素是一種小的調節性dànbáizhì,可以與其他dànbáizhì共價結合。泛素化可以影響dànbáizhì的降解、位置、活性以及dànbáizhì之間的相互作用。理解哪些dànbáizhì結構可以被泛素化需要從泛素化的機制和靶點特性入手。
圖1
泛素化的機制
泛素激活:泛素首先通過泛素激活酶(E1)被激活,并與之形成高能硫酯鍵。
泛素結合:激活的泛素然后被轉移到泛素結合酶(E2)。
泛素連接:泛素連接酶(E3)識別特定的底物蛋白,并協助將泛素從E2轉移到底物蛋白上。
可以泛素化的dànbáizhì結構:
1.靶位點特異性
賴氨酸殘基(Lysine residues):泛素化zuì常見的靶位點是賴氨酸(Lysine,K)殘基。泛素的C末端gānānsuān與賴氨酸的側鏈氨基形成共價鍵。
其他殘基:雖然賴氨酸是zuì常見的靶點,但泛素也可以連接到其他氨基酸殘基,如sīānsuān、sūānsuān和半guāngānsuān
2.泛素化位點序列:
某些dànbáizhì序列比其他序列更容易被泛素化。雖然沒有juéduì的序列特異性,但是研究顯示含有特定序列的肽段(如PXXLXQ)容易與E3泛素連接酶結合,促進泛素化。
3.結構的可及性:
dànbáizhì的三級結構會影響特定賴氨酸殘基的可及性。只有當E2泛素結合酶和E3泛素連接酶可以接觸到這些殘基時,泛素化才能發生。
4.dànbáizhì的柔性和動態性:
柔性較高的區域或者結構上具有一定動態性的dànbáizhì部分更容易發生泛素化,因為它們能夠更容易地適配于E2和E3酶的活性位點。
5.修飾的前體狀態:
dànbáizhì的其他翻譯后修飾狀態,如磷酸化、乙酰化等,有時可以增加dànbáizhì被泛素化的幾率,因為它們可以改變dànbáizhì的電荷、構象或者與E3泛素連接酶的親和力。
泛素化可以在多種不同類型的dànbáizhì結構上發生,但是這一過程往往偏好那些在空間結構上可以與E2和E3酶相互作用的賴氨酸殘基。dànbáizhì的泛素化狀態和功能受到其自身結構特征以及細胞環境中的多種因素的影響。
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